Research Scientist in computational comparative genomics, protein structure, and AI for crop im[...]

L'Institut SIB de Bioinformatique en Suisse recrute un chercheur.

Chercheur scientifique en génomique comparative, structure des protéines et IA pour l'amélioration des cultures

Responsabilités

• Développer des méthodes pour améliorer la reconstruction d'orthologie et l'inférence des HOG chez les plantes.
• Intégrer l'information sur la structure des protéines dans le flux de travail d'inférence d'orthologie OMA, afin d'améliorer la détection d'homologie profonde et de raffiner les HOG.
• Réaliser des inférences d'orthologie à grande échelle et des évaluations sur des jeux de données végétaux, y compris la collecte de génomes, le contrôle qualité, l'inférence d'arbres d'espèces et la reconstruction des HOG basée sur FastOMA.
• Construire ou assembler des jeux de données de référence de familles de gènes végétaux annotées, incluant des cas avec duplications et un large échantillonnage taxonomique.
• Évaluer les amélio...